Lue uutinen mobiilisivustolla

CSC:n supertietokone kartoittaa perimää

30.1.2004 17:02 Tieteen tietotekniikan keskuksen CSC:n superlaskentaympäristössä on tietokoneella tehty poikkeuksellisen suurella aineistolla ihmisen perimän läpikartoitusta.

Aineistoon on yhdistetty neljä genominlaajuista tutkimusta. Tämän lähes 4000 yksilöä kattavan aineiston analysointi on CSC:n mukaan mahdollista ainoastaan superlaskentaympäristössä, sillä analyysi vaatii laskenta-aikaa useita vuorokausia ja keskusmuistia useiden gigatavujen verran.

CSC:n mukaan hankkeen lopullisena tavoitteena on etsiä geenejä, jotka todennäköisesti vaikuttavat ihmisen pituuteen, painoon ja veren rasva-arvoihin.

Hankkeessa ovat mukana Helsingin yliopisto, Kansanterveyslaitos ja Malmön yliopisto, ja sitä johtaa akatemiaprofessori Leena Peltonen-Palotie.

Monitekijäiset sairaudet

Monitekijäisillä sairauksilla tarkoitetaan sairauksia, joiden puhkeamiseen vaikuttavat sekä perinnöllinen alttius että ympäristötekijät. Suurin osa kansanterveydellisesti merkittävistä sairauksista, esim. sepelvaltimotauti, valtimonkovettumatauti ja aikuisiän diabetes ovat tällaisia sairauksia.

- Tässä tutkimuksessa keskitytään näihin tauteihin liittyviin kvantitatiivisiin mittareihin, kuten veren rasva-arvoihin ja ruumiinmittoihin. Näihin muuttujiin vaikuttavien geenien löytäminen on tärkeää, koska ne toimivat riskitekijöinä useissa lääketieteellisesti merkittävissä tiloissa, sanoo tutkija Markus Perola Kansanterveyslaitokselta.

Perolan mukaan monimutkaisten geenivaikutusten selvittäminen vaatii suuria tutkimusaineistoja, joiden tilastollinen hyödyntäminen puolestaan vaatii entistä suurempaa laskukapasiteettia.

- Todennäköisesti tulevaisuudessa juuri biolääketieteelliset projektit asettavat suurimmat vaatimukset käytettävissä olevalla laskentakapasiteetille, arvioi Perola.

Kalevi Nikulainen toimitus@digitoday.fi

Kirjoita kommentti

Ohjeet: Pysy aiheessa ja kirjoita napakasti. Muista, että haastateltavilla, kanssakeskustelijoilla ja toimittajilla on oikeus omaan, eriävään mielipiteeseen. Ole kohtelias ja ystävällinen, äläkä tarkoituksella provosoi tai hauku muita keskustelijoita. Taloussanomat varaa oikeuden poistaa asiattomat viestit. Varauduthan siihen, että linkkejä sisältävät viestit tarkistetaan yksitellen roskapostin suodattamiseksi. Arvostamme mielipidettäsi!
Lue koko keskusteluetiketti

Bottivarmistus: mitä on kaksi ynnä viisi?

Viesti Nimi

Uutiset

Yksi kuoli ja kahdeksan haavoittui ammuskelussa Hyvinkäällä, ampuja yhä vapaana

• Pitkämäen keihään vahingoittama Sdiri vie IAAF:n oikeuteen
• Intian rikkain perhe avasi kohukotinsa ovet Vanity Fairille
• Valtio maksoi VR:n johtajalle eniten
• Afrikkalaisten maahanmuutto kiristää tunnelmia Tel Avivissa