Lue uutinen mobiilisivustolla

VTT:n uudella softalla sairauksien jäljille

25.4.2007 16:17 VTT on kehittänyt megNet-tietokoneohjelmiston monimutkaisten bio- ja lääketieteellisten tietoaineistojen yhdistämiseen ja visualisoimiseen. VTT on käyttänyt ohjelmistoa tutkimusprojekteissa, joissa kehitettiin menetelmiä muun muassa sydänsairauksiin ja diabetekseen liittyvien varhaisten muutosten havaitsemiseksi.

VTT:n mukaan MegNet mahdollistaa laajojen ihmisen fysiologiaan liittyvien tietoaineistojen yhdistämisen ja tietojenkäsittelyn. Tällaisia tekijöitä ovat esimerkiksi molekyylien väliset vuorovaikutukset, genomit, geenien ilmentyminen, soluaineenvaihdunta, lääketieteelliset kuvat ja kliiniset tietoaineistot.

Tutkimuskeskus soveltaa ohjelmaa eri sairauksiin liittyvien, elimistössä tapahtuvien varhaisten muutosten eli biomarkkerien tunnistamiseen. Sitä voidaan hyödyntää myös lääkekehityksessä ja muussa terveydenhoidossa. MegNet-ohjelmisto vastaa tarpeisiin hyödyntää tehokkaasti perustutkimuksen tuloksia potilaiden hoidossa.

Käsitteellinen tila

Ohjelman kehitystyö perustuu käsitteellinen tila -teoriaan (conceptual space), joka soveltuu tiedon louhintaan ja visualisointiin. VTT hyödynsi työssä uusimpia 3d-tekniikoita, matemaattista mallinnusta ja kontekstin tunnistusta. Käsitteellinen tila -teoria yhdistää kognitiivisen tieteen, psykologian ja lingvistiikan teorioita. Se tarkoittaa ennalta valittujen ominaisuuksien mukaan järjestettyä tilaa ja perustuu informaatiotilan topologiseen analysointiin.

VTT on soveltanut megNet-ohjelmistoa tutkimusprojekteissaan. VTT:n rahoittamassa Visubiomed-projektissa systeemibiologian, signaalinkäsittelyn ja lääketieteellisen kuvankäsittelyn asiantuntijat analysoivat sydämestä otettuja magneettikuvia ja jatkossa muutakin sydänsairauksiin liittyvää kliinistä tietoaineistoa. Potilaiden verinäytteistä voidaan analysoida aineenvaihduntatuotteet.

Tietoaineistoa täydennetään MegNet-ohjelmiston avulla sairauteen liittyvällä molekyylitason tutkimustuloksilla ja molekyylien vuorovaikutustiedoilla. Transcendo-projektissa VTT:n tutkijat ovat soveltaneet megNetiä diabeteksen varhaisen havaitsemisen diagnoimiseksi.

Hanke tehdään yhteistyössä sairaaloiden kanssa.

Tuomas Karvonen toimitus@digitoday.fi

Kirjoita kommentti

Ohjeet: Pysy aiheessa ja kirjoita napakasti. Muista, että haastateltavilla, kanssakeskustelijoilla ja toimittajilla on oikeus omaan, eriävään mielipiteeseen. Ole kohtelias ja ystävällinen, äläkä tarkoituksella provosoi tai hauku muita keskustelijoita. Taloussanomat varaa oikeuden poistaa asiattomat viestit. Varauduthan siihen, että linkkejä sisältävät viestit tarkistetaan yksitellen roskapostin suodattamiseksi. Arvostamme mielipidettäsi!
Lue koko keskusteluetiketti

Bottivarmistus: mitä on kaksi ynnä viisi?

Viesti Nimi

Uutiset

Hyvinkään ammuskelu vaati toisen kuolonuhrin

• Ampumisessa haavoittunut poliisi on 23-vuotias nainen
• Tahkon pelaaja kuoli, kaksi muuta loukkaantui Hyvinkään ammuskelussa
• Hyvinkään ampumatapauksen uhrit nuoria miehiä ja naisia
• Silminnäkijät luulivat ammuskelua ensin raketeiksi