Lue uutinen mobiilisivustolla

Geeni- ja sairaustiedot kerätään samaan järjestelmään

Kuva: Jussi Nukari/Lehtikuva

25.1.2008 13:50 Eurooppalainen tutkimushanke luo yhteistä tietoperustaa geenien ja sairauksien yhteyksistä.

GEN2PHEN-projektin tavoitteena on koota ja yhdistää geenien ja yleisten sairauksien välisistä yhteyksistä kertyvä tieto yhteiseen tietojärjestelmään, jolloin tutkimustulokset pystyttäisiin mahdollisimman nopeasti hyödyntämään myös sairauksien diagnosoinnissa ja hoidossa.

Euroopan komission rahoittama kahdentoista miljoonan euron GEN2PHEN-hanke aikoo valjastaa internetin avuksi sellaisen geneettisen informaation kokoamisessa, jolla on merkittävä vaikutus ihmisen terveyteen ja esimerkiksi sellaisten yleisten sairauksien kuin diabeteksen, lihavuuden, sydänsairauksien ja syövän kehittymiseen.

Hankkeessa on mukana 19 yliopistoa, tutkimuskeskusta ja yritystä kahdestatoista Euroopan maasta sekä Intiasta ja Etelä-Afrikasta. Suomesta hankkeeseen osallistuvat Helsingin yliopiston Meilahden kampuksella toimiva Suomen molekyylilääketieteen keskus FIMM sekä Biocomputing Platforms Ltd Oy.

Projektia johtava professori Anthony Brookes Leicesterin yliopistosta toteaa, että yleisiin sairauksiin liittyvien geneettisten variaatioiden tutkimiseen tarkoitetut teknologiat on kehitetty muutaman viime vuoden aikana ja ne ovat vasta nyt tulossa laajaan käyttöön.

- Odotettavissa on nyt ennennäkemätön ryöppy jännittäviä, arvokkaita ja tärkeitä tutkimushavaintoja. Kuitenkaan ei ole olemassa mitään maailmanlaajuista järjestelmää, joka voisi ottaa vastaan, tallentaa ja yhdistää kaiken tämän tiedon sekä saattaa sen tutkijoiden ulottuville arvioitavaksi ja hyödynnettäväksi, Brookes sanoo.

GEN2PHEN-hanke koordinoi sellaista sähköisen datan kokoamista ja käyttöä, joka selvittää geneettisten variaatioiden yhteyksiä ihmisten välisiin eroihin sairastavuudessa ja lääkevasteissa. Näiden yhteyksien selvittäminen on olennaista diagnostiikan ja hoidon kehittämisessä.

Hankkeen osanottajat kehittävät tietokantojen, työkalujen ja teknologioiden yhdistelmän, jonka avulla kaikki olennainen tutkimuksen tuottama tieto geenivariaatioiden ja sairauksien yhteyksistä pystytään järkevällä tavalla yhdistämään ja saattamaan välittömästi tutkijoiden ulottuville GEN2PHEN Knowledge Centre -portaalin kautta.

Suomalainen tutkimusryhmä osallistuu tietokanta- ja tiedonsiirtostandardien luomiseen sekä tiedon yhdistämisessä tarvittavien menetelmien kehittämiseen, kertoo ryhmää johtava Suomen Genomikeskuksen tietojärjestelmäpäällikkö, FT Juha Muilu.

Jarmo Lahti toimitus@digitoday.fi

Teksti on lisensoitu Creative Commons Nimeä-Ei muutoksia-Epäkaupallinen -lisenssillä.

Kirjoita kommentti

Ohjeet: Pysy aiheessa ja kirjoita napakasti. Muista, että haastateltavilla, kanssakeskustelijoilla ja toimittajilla on oikeus omaan, eriävään mielipiteeseen. Ole kohtelias ja ystävällinen, äläkä tarkoituksella provosoi tai hauku muita keskustelijoita. Taloussanomat varaa oikeuden poistaa asiattomat viestit. Varauduthan siihen, että linkkejä sisältävät viestit tarkistetaan yksitellen roskapostin suodattamiseksi. Arvostamme mielipidettäsi!
Lue koko keskusteluetiketti

Bottivarmistus: mitä on kaksi ynnä viisi?

Viesti Nimi

Uutiset

Hyvinkään ampumisten kuolonuhrit olivat ammattikoulu Hyrian opiskelijoita

• Sisäministeri Räsäsen lasten tuttavia joutui ammuskelun uhreiksi
• Tahkon pelaaja kuoli, kaksi muuta loukkaantui Hyvinkään ammuskelussa
• Ampumisessa haavoittunut poliisi on 23-vuotias nainen
• Hyvinkään ampumatapauksen uhrit nuoria miehiä ja naisia