Lue uutinen mobiilisivustolla

Supertietokoneiden käyttäjät koolla Helsingissä

CSC:n konesali Otaniemessä.
Kuva: CSC / Lehtikuva

6.5.2008 11:41 CUG-konferenssi on koonnut Helsinkiin 150 Cray-supertietokoneiden käyttäjää ja ylläpitäjää maailman supertietokonekeskuksista. Tapahtuma alkoi maanantaina ja päättyy torstaina.

Tämänkertaisen CUG2008 (Cray User Group) –konferenssin paikallisena järjestäjänä toimii opetusministeriön omistama tieteen tietotekniikan keskus CSC, jonka tehokkain supertietokone Cray XT4 eli Louhi otettiin käyttöön vuosi sitten.

Kokoontumisen teemana on Crossing the Boundaries. Laskennallisen tieteen ja suurteholaskennan kehitys on mahdollistanut erilaisten laskennallisten mallien kytkemisen ja monitieteellisen tutkimuksen.

CSC:n mukaan teema viittaa myös rajojen ylittämiseen akateemisen tutkimuksen ja teollisuuden harjoittaman tutkimusten ja tuotekehittelyn välillä, kuten myös jatkuvasti kasvavaan kansainväliseen yhteistyöhön.

Avajaispäivän pääpuhujana oli professori Ilpo Vattulainen (TTY, TKK), jonka tekemät simulaatiot CSC:n Cray-supertietokoneella ovat tuottaneet merkittävää uutta tietoa molekyylibiologiasta.

Tietokonesimulaatiot ennustavat, että solukalvojen fysikaalisia ominaisuuksia muuttamalla voidaan vaikuttaa solukalvoproteiinien aktiivisuuteen ja siten lukuisiin solutason biologisiin funktioihin.

Biologiset solukalvot ovat erittäin ohuita ja monimutkaisia rakenteita, jotka koostuvat pääasiassa moninaisista lipidimolekyyleistä, proteiineista ja hiilihydraateista.

Monimutkaisille biologisille systeemeille kuten solukalvoille on tyypillistä pituus- ja aikaskaalojen vaihtelu, joka on laskennallisesti hyvin haastavaa. Erityisesti lipidisysteemien tutkimisessa pitää huomioida samaan aikaan sekä pieniä atominkokoisia systeemejä että suurempia systeemejä: nanokokoisista lipideistä 10-25 nanometrin kokoisiin lipoproteiineihin ja edelleen mikrometrin kokoluokkaa oleviin solukalvoihin. Ilpo Vattulainen esitteli keinoja miten näitä skaaloja voi yhdistää.

Ensimmäinen CUG järjestettiin vuonna 1978, ja tämänkertainen konferenssi on järjestyksessä 50. CUG-konferenssi ja samalla 30-vuotisjuhlakonferenssi.

Kalevi Nikulainen toimitus@digitoday.fi

Teksti on lisensoitu Creative Commons Nimeä-Ei muutoksia-Epäkaupallinen -lisenssillä.

Kirjoita kommentti

Ohjeet: Pysy aiheessa ja kirjoita napakasti. Muista, että haastateltavilla, kanssakeskustelijoilla ja toimittajilla on oikeus omaan, eriävään mielipiteeseen. Ole kohtelias ja ystävällinen, äläkä tarkoituksella provosoi tai hauku muita keskustelijoita. Taloussanomat varaa oikeuden poistaa asiattomat viestit. Varauduthan siihen, että linkkejä sisältävät viestit tarkistetaan yksitellen roskapostin suodattamiseksi. Arvostamme mielipidettäsi!
Lue koko keskusteluetiketti

Bottivarmistus: mitä on kaksi ynnä viisi?

Viesti Nimi

Uutiset

Krp: Hyvinkään ampujan uhrit näyttävät valikoituneen sattumanvaraisesti

• Hyrian rehtori: Uhrit olivat luokkansa priimuksia
• Yksi Hyvinkään ammuskelussa haavoittuneista yhä kriittisessä tilassa
• Paatero: Poliisi toimi oikein ampumispaikalla
• Tahkon pelaaja kuoli, kaksi muuta loukkaantui Hyvinkään ammuskelussa