Lue uutinen mobiilisivustolla

Nuoret tutkijat pääsivät käyttämään CSC:n Cray-superkonetta

CSC:n konesali Espoossa.
Kuva: CSC / Lehtikuva

16.12.2008 07:36 Tieteen tietotekniikan CSC keskus julisti vuonna viime vuonna haettavaksi apurahoja nuorten tutkijoidenlaskennallisen tieteen tutkimus- ja kehitystyöhön. Apurahaohjelman avulla palkitut saivat mahdollisuuden käyttää CSC:n tehokkainta Cray XT4 -supertietokonetta tutkimustyössään.

CSC:n mukaan nuorille tutkijoille suunnatut superlaskenta-apurahat ovat tuottaneet hyviä tuloksia. Niiden avulla on kehitetty uusia laskentamenetelmiä, työkaluja ja tekniikoita tutkimuksen käyttöön. Apurahojen avulla toteutetuista hankkeista on ilmestynyt raportti, joka on luettavissa verkko-osoitteessa http://www.csc.fi/csc/julkaisut/vuosikertomukset_ja_raportit

CSC:n ohella apurahajärjestelyihin osallistuivat myös Cray ja mikroprosessorivalmistaja AMD. Palkitut saivat laskenta-aikaa Cray XT4 -supertietokoneesta.  Lisäksi he voivat käyttää CSC:n asiantuntijapalveluja tehokkaiden laskentamenetelmien toteutuksessa, Elmer-ohjelmiston käytössä sekä ilmastomallien soveltamisessa.

Apurahan hakijoita oli yhteensä 37, joista valittiin seitsemän hanketta. Valintaan osallistuivat Helsingin yliopiston ja Teknillisen korkeakoulun tietojenkäsittelytieteen professori Heikki Mannila sekä johtaja Juha Haataja, nanotieteen asiantuntija Jura Tarus ja sovellusasiantuntija Juha Fagerholm CSC:stä.

Palkitut olivat Mikko Hakala, Petri Hiltunen, Tomi Huttunen, Marko Laakso, Lauri Lehtovaara, Sergio Losilla ja Nina Pietikäinen.

SIESTA sai uusia
ratkaisijoita

Hakalan vetämä hanke kehitti uusia ratkaisijoita SIESTA-ohjelmistoon. Niiden avulla ohjelmiston rinnakkaistuminen tehostuu ja laitteiston kuormitus tasapainottuu. SIESTA-ohjelmisto on akateemisessa käytössä suosittu tiheysfunktionaaliohjelmisto.

Hiltusen kehittämä algoritmi liittyy optiseen tomografiaan. Se parantaa numeerisen aineiston perusteella tuotettujen kuvien luotettavuutta. Käytännön sovellusalueena on esimerkiksi hapen kyllästymisasteen mittaaminen elävässä kudoksessa.

Huttusen projektissa kehitettiin tehokkaita menetelmiä suuren mittakaavan aalto-ongelmiin. Sovelluskohteita löytyy ilmailuteollisuudesta biologisten kudosten mallinnukseen.

Laakson ryhmä tutki rintasyöpäpotilaiden eloonjäämisennusteita tutkimalla geenimuunnoksia, jotka lisäävät syöpäalttiutta. He toteuttivat menetelmänsä sekä R- että Fortran-kielillä.

Elementtimenetlmä
käytössä

Lehtovaaran johtamassa hankkeessa käytettiin elementtimenetelmää elektronien rakenteen laskemiseen. Tutkimuksessa käytettiin CSC:ssä kehitettyä Elmer-ohjelmistoa.

Losillan ryhmä käytti uutta lähestymistapaa biomolekyylien elektrostaattisten jännitteiden laskemiseen. Käyttöön otettu uusi rinnakkaistustapa mahdollistaa koodin ajamisen jopa sadoissa prosessoreissa rinnakkain.

Pietikäisen ryhmä vertasi eri tapoja parametrisoida pilvien koostumusta. Työ perustui ECHAM5-ilmastomalliin. Tulosten perusteella tarvitaan vielä lisätutkimuksia, jotta löydettäisiin parametrit, jotka vastaavat parhaiten tehtyjä havaintoja.

Juha Haataja pitää tuloksia hedelmällisinä sekä palkittujen että koko Suomen tutkimusjärjestelmän kannalta.

- Maassamme tarvitaan tämänkaltaista osaamista, jotta kyettäisiin vastaamaan modernin yhteiskunnan asettamiin tutkimushaasteisiin.

- Laskennallinen tiede perustuu monitieteellisiin innovaatioihin ja hyödyntää aikaisempaa tietämystä. Se vie tutkimusta eteenpäin sekä vähittäisten parannusten että välistä myös suurempien hyppäysten avulla. Yhteistyötä tarvitaan laskennallisen tieteen taitojen parantamiseksi. Vaikka apurahaohjelman tulokset ovat vaikuttavia, tämä oli vasta ensimmäinen askel oikeaan suuntaan, Haataja sanoo.

Suomen Akatemia on käynnistämässä ensi vuoden alussa laskennallisten tieteiden tutkimusohjelmaa. Sen toivotaan edelleen kehittävän alueen osaamista maassamme.

Kalevi Nikulainen toimitus@digitoday.fi

Teksti on lisensoitu Creative Commons Nimeä-Ei muutoksia-Epäkaupallinen -lisenssillä.

Kirjoita kommentti

Ohjeet: Pysy aiheessa ja kirjoita napakasti. Muista, että haastateltavilla, kanssakeskustelijoilla ja toimittajilla on oikeus omaan, eriävään mielipiteeseen. Ole kohtelias ja ystävällinen, äläkä tarkoituksella provosoi tai hauku muita keskustelijoita. Taloussanomat varaa oikeuden poistaa asiattomat viestit. Varauduthan siihen, että linkkejä sisältävät viestit tarkistetaan yksitellen roskapostin suodattamiseksi. Arvostamme mielipidettäsi!
Lue koko keskusteluetiketti

Bottivarmistus: mitä on kaksi ynnä viisi?

Viesti Nimi

Uutiset

Seksuaalirikoksesta epäilty valmentaja löytyi kuolleena sellistä

• Putkirikko loi pienen järven Sörnäisten rantatielle – katso video
• Leijonat takoi ennätysnumerot T?ekistä
• Miljoonien viinakokoelma myyntiin vaimon vuoksi
• Kreikkaan vaaditaan uusia vaaleja